St. Jude儿童研究医院将基因组数据库迁移到云端，为世界各地的科学家提供了一个平台。
当您处理大量科学数据时，可能需要一些时间才能将其全部放入云中。但是，一旦数据进入云端，就可以轻松地在世界任何地方试验您的数据。——您只需下载结果即可。然而，正如田纳西州孟菲斯市St. Jude儿童研究医院的高级副总裁兼首席信息官Keith Perry所理解的那样，允许研究人员接受这种范式转变可以得到组织内外的合作伙伴的支持。
云应用案例：圣犹达使用云来对抗儿童癌症
St. Jude正致力于绘制儿童癌症遗传图谱，作为寻求治疗的一部分。 St. Jude使用基因测序（基本上所有DNA）来确定患者中健康细胞和肿瘤的全基因组序列。比较两者（并比较具有相似癌症的其他患者的基因组）可以为治疗提供重要线索。
这是一个非常重要的数据问题。 St. Jude记录了超过5,000名患者的全基因组序列，每个患者约占100千兆字节。研究人员可能只在少数这些字节中寻找突变或其他遗传标记。
由于这些儿童期癌症很少见，世界各地的研究人员都想比较数据——，但由于数据太多，很难比较。 Perry举了一个研究员的例子，他花了六个月下载一个庞大的数据集并检查其质量，然后花了几天时间分析它。
佩里说：“医疗行业仍在努力下载数据。但它尚未达到必须在云计算中进行计算的关键点。”我必须下载数据的心态“仍然存在，尽管我们正在慢慢消除这一点视图。”
这就是St. Jude创建St. Jude Cloud的原因之一，研究人员和其他人可以在其中托管和试验数据。
创建St. Jude Cloud的另一个原因是St. Jude的筹款模式。佩里说：“我们是一个慈善机构。我们的重点是找到治疗方法并帮助这些孩子。我们非常重视......我们无法提供我们正在制作的数据或我们正在塑造的概念。将其视为它本身就是一种东西。我们只管理正在产生的知识。“跨部门合作
St. Jude选择与专注于遗传学的DNAnexus合作，而不是从头开始创建数据共享平台。然后，它开始寻找云提供商，最终选择了微软的Azure平台。
Perry说：“在使用云技术方面，我们的任务是创建一个共享的生态系统。这个系统不仅基于文件共享机制，我们发现研究行业使用这样一种机制。创建的能力基于数据的工具和计算能力更接近系统的本质。“
Perry说，如果St. Jude的计算微生物学主任张景辉和她的团队没有参加，St。Jude的云项目将不可能赢得2019年Digital Edge 50数字创新奖。
由Zhang的部门编写的软件从基因组测序仪获取数据并对其进行处理，以帮助研究人员了解基因组的特征及其包含的所有突变。他说：“她开发的工具和她的研究团队开发的工具确实已在全球范围内得到应用。”
IT与计算微生物学之间的合作创建了St. Jude Cloud。
佩里说：“他们本可以离开并开发一个没有IT的云架构，我们应该感到沮丧”，但IT部门可以证明合作的价值。 “我们可以帮助他们将所有数据移植到Azure的云端；这需要很长时间。”尽管如此，Perry的网络团队花了数月时间上传数据并对其进行质量测试。
下一步是代码优化：一旦计算生物学团队开发工具，IT人员就可以加快速度。对于这些职位，佩里通常会寻找具有博士学位的候选人。在计算科学和专注于高性能计算。
Perry说：“他们就是这样一群人.——真正致力于理解高性能计算机的工作原理，并致力于理解在其中一台计算机中优化代码的最佳方法，这些人很难找到。”
该程序员最初的目标是St. Jude的内部研究集群，该集群拥有6400个计算核心。一旦集群准备好生产，或者将与其他人共享，它将被移植到云端。
鉴于从高性能计算（HPC）开始的博士学位很少，内部培训一直是向云迁移的关键组成部分。佩里说：“当我们设立一个职位时，我们引进了一群来自外部的人，但我们主要希望使用首先参与我们使命的人，然后我们可以教他们如何在云中做出改变计算行业。这是一种不同的思维方式。“
St. Jude的其他IT贡献包括在早期阶段将信息安全工作纳入项目，以保护患者数据并允许互联网设计团队帮助设计St. Jude Cloud门户。佩里说：“我们已经将云计算范例（如果你不介意这样的名字）整合到一个正常的信息安全计划中。我们有一家外部公司为我们做渗透测试，我们放宽了他们的限制，他们可以测试你想要的云基础设施。“
你如何处理这些测试的结果非常重要，佩里说：“这不是一种惩罚性的练习。相反，”无论这是我们需要加强的过程还是技术，问题是我们能否找到并找出答案。信息范围的差距？“所以这对我们来说是一个非常有用的练习。
沟通愿景
在设计方面，St。Jude所做的最有趣的事情是它与自己的营销和沟通团队的合作。
佩里说：“我在我的职业生涯中已经了解到IS或IT真的不善于推广他们所做的事情”，但为了使St. Jude Cloud取得成功，团队不仅要说服内部用户，还要让用户其他研究机构相信他们提供的数据。
佩里试图确保营销团队在清晨参与该项目。他说：“营销团队帮助我们提供简明有力的信息，让人们在团队参与的各种会议中更加积极主动。他们还有机会就一些设计特点和流程发表意见。我们的营销传播团队非常好。因为他们也了解研发社区。“
Perry表示，St。Jude Cloud赢得外部用户的一种方式是专注于实现价值，而不仅仅是提供信息。 “当我们去年开放平台时，它已经拥有非常丰富的数据。这是一个与儿科相关的非常大的测序数据集。我们计划增加规模。我们还没有这样做。——站起来说'我们要创建这个平台'。相反，我们站起来说，'嘿，我们已经创建了平台，它准备就绪。'“
虽然Perry想要认识到IT团队创造的价值，但他也看到了缺点：“我们必须承认，作为一个行业，并非所有价值观都是由IT内部创造的，IT部门之外的部门正在创造价值。这就是伙伴关系。“

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